- Positiivisen psykologian käsikirja (2023)
- Miksi? Onnellisuusprofessori pohtii suuria kysymyksiä, osa 2: Geenit, ympäristö ja tilannetekijät (2022)
- Miksi? Onnellisuusprofessori pohtii suuria kysymyksiä, osa 1: Yhteiskunta, kulttuuri ja politiikka (2021)
- Hyvän elämän rakennuspuut (2020)
- Kysymyksiä onnellisuudesta (2019)
- Voiko persoonallisuus muuttua? (2019)
- Kulmikas ihmiselämä (2018)
- Onnellisuuksien oivaltaja: Mitä tiede kertoo onnesta? (2018)
- Vaihtoehtoisia faktoja? Miksi valehtelemme (2017)
- Kaikki on hyvin juuri nyt (2015)
- Heikko ja vahva usko (2015)
- Suomi, ihan oikeasti (2015)
- Tunne vai järki (2014)
- Positiivinen psykologia (2014)
- Selviytyjiä & kukoistaja (2013)
- Onnellisuuden käsikirja (2013)
- Murra onnellisuuden esteet (2013)
- Urheilupsykologian perusteet (2012)
- Minä ja muut (2011)
- Uudistava usko (2011)
- Suomalaisen onnellisuuden ja hyvinvoinnin tulevaisuus (2011)
- Ahdas ateismi (2011)
- Onnellisuusprofessorin päiväkirja (2009)
- Terveenä kaiken ikää (2009)
- Hyvinvoinnin käsikirja (2009)
- Positiivinen psykologia (2007)
- Onnellisuus (2006)
- Hyvä, paha ihminen (2006)
- Persoona – Persoonallisuuspsykologia (2004)
- Onnen etsijät (2004)
- Terapiastako ratkaisu (2004)
- Elämän mieli ja merkitys (2002)
- Ilo, onni, hyvinvointi (2001)
- Liiku oikein, voi hyvin (2001)
- Hyvään elämään. Terapia ja sielunhoito II (2000)
- Terapia ja sielunhoito (1999)
- Hoito vai pakkohoito (1997)
- Sopimusvuoren kaksi vuosikymmentä (1995)
- Itsetuntemusta etsimässä (1993)
- Mikä minä on? (1993)
- Auta auttamaan – Käsikirja työnohjauksesta (1988)
- Skitsofrenia (1986)
- Sopimusvuoren terapeuttiset yhteisöt (1984)
Kokoelmateokset
Nämä teokset sisältävät Markulta artikkeleja tai muuta sisältöä.